Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1839.1 ms