Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nus1Q99LJ8 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nus1Q99LJ8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nus1Q99LJ8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nus1Q99LJ8 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nus1Q99LJ8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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