Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krcc1Q99JT5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms