Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Apobec3Q99J72 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Apobec3Q99J72 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Apobec3Q99J72 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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