Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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