Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdc16Q8R349 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms