Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hecw1Q8K4P8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms