Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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