Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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