Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms