Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FarsaQ8C0C7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms