Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms