Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pdcl3Q8BVF2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms