Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Amigo1Q80ZD8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Amigo1Q80ZD8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Amigo1Q80ZD8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Amigo1Q80ZD8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.8 ms