Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms