Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms