Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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