Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprjQ64455 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprjQ64455 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprjQ64455 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PtprjQ64455 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PtprjQ64455 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PtprjQ64455 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PtprjQ64455 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprjQ64455 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprjQ64455 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms