Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa17Q64016 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms