Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RelnQ60841 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RelnQ60841 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms