Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms