Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms