Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms