Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms