Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim58Q5NCC9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim58Q5NCC9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trim58Q5NCC9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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