Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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