Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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