Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms