Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms