Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a1Q00780 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a1Q00780 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms