Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pitx2P97474 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms