Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 387 ms