Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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