Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UbdP63072 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms