Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snrpd1P62315 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms