Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms