Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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