Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms