Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms