Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VtnP29788 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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