Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RarbP22605 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RarbP22605 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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