Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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