Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtcP11725 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtcP11725 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtcP11725 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
OtcP11725 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtcP11725 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtcP11725 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtcP11725 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms