Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms