Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms