Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChkaO54804 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChkaO54804 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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