Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kpna3O35344 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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