Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms