Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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