Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint7A7XV04 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms